Trong quá trình đàm phán hòa bình với người Klingon, thuyền trưởng Kirk và ngài Spock bị buộc tội giết người khi tàu của người Klingon bị tấn công.

Trong hành trình tìm kiếm Chúa đầy ám ảnh, một người Vulcan nổi loạn cướp tàu Enterprise rồi đưa thuyền trưởng Kirk cùng phi hành đoàn đến trung tâm của thiên hà.

Phi hành đoàn của 2 tàu vũ trụ Enterprise và Excelsior bằng mọi cách phải ngăn chặn cho được một âm mưu của những kẻ hiếu chiến nhằm phá hoại đàm phán hòa bình giữa phe Liên Bang và đế quốc Klingon...…

Cơ trưởng Kirk và phi hành đoàn Enterprise dũng cảm có xung đột nguy hiểm với Klingon, Romulan, nhân vật hình người huyền bí và các chủng tộc người ngoài hành tinh khác.

Tiếp tục những chuyến phiêu lưu ngoài vũ trụ, Spock đến thăm hành tinh quê nhà, Scotty đối mặt với tội giết người và nhà hàng hải người Nga Chekov gia nhập Enterprise.

Được lãnh đạo bởi Cơ trưởng Kirk điềm tĩnh, phi hành đoàn của phi thuyền Enterprise tiến sâu vào không gian xa xôi để khám phá những thế giới và nền văn minh mới.